Vid biogasproduktion förs en betydande del av substratens kolinnehåll bort tillsammans med biogasen. Med en ökad tid i biogaskammaren utvinns mer kol i processen och mängden kol i rötresten minskar. I två danska undersökningar har man undersökt hur ökad tid i rötkammaren för substratet påverkar mängden stabiliserat kol i marken efter att rötresten har spridits i fält.
